Яна Вагнер родилась в 1973 году в Москве, в двуязычной семье. Вагнер - фамилия ее матери, приехавшей в СССР из Чехословакии.
Закончила РГГУ, работала переводчиком с английского, диктором на радио, более десяти лет занималась транспортной логистикой.
Ее дебютный роман "Вонгозеро" в 2011 году был номинирован сразу на две крупных литературных премии - "Национальный бестселлер" и "НОС", переведен на несколько европейских языков, готовится экранизация романа. В 2013 году издано продолжение этого романа "Живые люди".