Марк Хэддон родился в 1962 году в Нортгемптоне. Учился в школе Аппингем и в Оксфорде (колледж Мертон) на факультете английского языка. Имеет степень бакалавра искусств по английскому языку и литературе.
В молодости работал с людьми, больными аутизмом, что впоследствии помогло ему в написании книги "Загадочное ночное убийство собаки" про мальчика, страдающего синдромом Аспергера.
Марк Хэддон - вегетарианец и любит готовить. Называет себя убеждённым атеистом.
Живёт в Оксфорде со своей женой Сос Элтис и двумя сыновьями.